苗医用药多是植物药、动物药及少量矿物药。药的特征归纳起来有热、冷和不热不冷三种；热药可治冷病，冷药可治热病，和药可补体质、治亏损病。药物的“结构素质”决定药力及药性：“质粘者易消化，补气力，清头脑；质糯者难消化，强筋生血，易伤肚；质沙者好吃，补血肉，和血脉，较难消化，容易产生多屁；质面者糊口，补肉补气，利关节，较易消化，多食令人胃弱......”。
苗药对采制有一定要求。植物药在有效成分富足时采集。如根类药宜在植株茂盛至翌年抽苗前采集，茎叶宜在生长旺期，花类宜在待放时，果实在初熟间，芽力求娇嫩鲜美，皮类以浆汁富足为好，鱼、虾、虫、兽要辨别真假，腐败者不能入药；矿物、金属宜剔净杂质。药物制作包括一般加工、炮制、提炼、合成及剂型改革等。
苗医用药配方有两个法则，配单不配双及三位一体。配单不配双，就是只用1，3，5，7，9之类成单的药物种数配方，而不用2，4，6，8之类成双的药物种数配方。三位一体，就是领头药、铺底药、监护药三类药物共组成方。领头药，是针对病情起主要作用的药；铺底药，是对领头药有相资作用或对身体有补益作用的药；监护药，是缓解领头药、铺底药的劣性和毒副作用，督促共达病所的药。这三类功用药与别的药物共配成方，形成三位一体，才能发挥药物的良好疗效。因此，在选药配方时，在选药上、用药分量上、制作方法上以及服药方式、禁忌事项等方面，都要注意发扬事物之间的良性关系，达到最佳的治疗效果